Salah satu agenda untuk membentuk santri sesuai dengan visi pesantren adalah kajian khusus bersama Pengasuh Pesantren, KH. Hery Saparjan Mursi, MA setiap Jumat pagi. Agenda ini dimulai dari shalat subuh berjamah dengan bacaan surat As-Sajadah di rakaat pertama dan surat Al-Insan di rakaat kedua. Dalam kajian ini, seluruh santri baik banin (Putra) dan banat (Putri) wajib mengikuti dan hadir di Masjid Pondok Quran 1.
Dalam kajian ini, pengasuh Pesantren PQBS memberikan pesan-pesan khusus kepada santri terkait motivasi, hukum, tadabbur Al-Quran, tafsir dan hadits sesuai kebutuhan kekinian. Agenda ini dimaksudkan agar santri bisa tersambung secara batin dan keilmuan kepada pengasuh pesantren.
Selain tausiah, dalam agenda ini juga sering diadakan momen khataman bagi santri yang menyelesaikan setoran 30 juz, juga pemberian apresiasi kepada santri atau kelompok santri yang berprestasi.